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Pour le fait de vider entièrement avant de remplir, je pense que c'est tout simplement dû au fait que le 407c est un mélange de 3 gaz, non azéotropique de surcroît (doit donc être chargé en phase liquide). Or une fuite peut très bien provoquer le départ d'un ou deux gaz prioritairement (si c'est une microfuite, la taille des molécules intervient et toutes ne sont pas susceptibles de pouvoir partir) auquel cas ton 407c voit changer ses propriétés physiques puisque sa composition sera différente. Pour un gaz monoespèce, tu pourrais faire l'appoint directement, pas de possibilité de modifier sa composition, c'est 100 % de gaz X.
Par contre, si la fuite est trop importante, il faut s'assurer que le système ne contient pas d'air, auquel cas il faudrait effectivement tirer au vide à nouveau. Normalement l'air ne devrait pas rentrer puisque le système est encore suffisamment pressurisé je suppose (?).